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Shadeで作成したデータをShade ドリームハウスに読み込むと、立方体や直方体の塊になってしまうのですが、何かデータに問題があるのでしょうか？

ブーリアンレンダリングを用いてくりぬいたデータの場合には、ブーリアンレンダリングの結果は他のソフトウェアにデータを読み込んだ場合には反映されませんので、くりぬくための形状がそのまま読み込まれていることが考えられます。
ブーリアンモデリングを用いることで、この問題は回避できます。